Montpellier, carrefour de la recherche agronomique
Peu de villes françaises réunissent autant d’organismes consacrés à l’agriculture et à l’environnement. Le CIRAD, spécialisé dans l’agronomie des régions tropicales et méditerranéennes, l’IRD, le centre INRAE Occitanie-Montpellier et l’Institut Agro Montpellier y travaillent côte à côte. L’association Agropolis International fédère les institutions d’enseignement supérieur et de recherche actives en agro-environnement dans la région, aux côtés de l’Université de Montpellier, et associe à sa gouvernance collectivités et acteurs du territoire. Ses priorités affichées : réduire les impacts environnementaux de l’agriculture, l’adapter au changement climatique et produire une alimentation saine et accessible.
Cette concentration attire des semenciers, des sociétés de biocontrôle, des éditeurs d’outils d’agriculture de précision et des bureaux d’études en environnement. Pour eux, le crédit d’impôt recherche se joue souvent sur des cycles longs : une saison de culture, plusieurs années d’essais au champ, des résultats qui dépendent du climat.
Santé, eau, numérique : la diversité scientifique de la métropole
En santé, l’Institut du Cancer de Montpellier et le CHU forment, avec les unités de l’université et des organismes nationaux, un ensemble clinique et scientifique. L’Institut de Génomique Fonctionnelle, unité du CNRS, de l’Inserm et de l’université, en est un exemple. Les biotechs régionales trouvent un relais auprès d’Eurobiomed, actif en Occitanie comme en région Sud.
Sur l’eau, HydroSciences Montpellier, placé sous la tutelle de l’Université de Montpellier, du CNRS et de l’IRD, étudie les effets du climat et des activités humaines sur le cycle de l’eau, les transferts en milieu hétérogène et la dynamique des contaminants métalliques et émergents. Ces travaux nourrissent une filière d’entreprises de l’eau qui conçoivent capteurs, traitements et outils de gestion de la ressource.
Côté numérique, le LIRMM, laboratoire de l’université et du CNRS installé sur le campus Saint-Priest, couvre trois départements : informatique, robotique et microélectronique. Les jeunes entreprises technologiques passent souvent par le BIC de Montpellier, l’incubateur d’entreprises innovantes de la ville.
Exemples de travaux qui relèvent de la recherche
Végétal, sols et agroécologie
Un semencier qui cherche à associer tolérance à la sécheresse et qualité de grain, sans savoir si les deux caractères sont compatibles génétiquement, mène des travaux à issue incertaine. Il en va de même d’une PME qui met au point un agent de biocontrôle dont l’efficacité varie selon les sols. Les pièces utiles : protocoles d’essais pluriannuels, données de phénotypage, analyses statistiques, notes expliquant pourquoi une lignée a été écartée. Les essais réglementaires d’homologation, la production de semences commerciales ou la démonstration d’un produit à des clients ne sont pas de la recherche.
Ressources en eau et dépollution
Un bureau d’études qui développe un procédé pour éliminer des micropolluants peu étudiés, ou un modèle de prévision d’étiage sur des bassins karstiques, peut se heurter à une connaissance scientifique lacunaire. Les tests en pilote, les analyses de laboratoire et la comparaison des performances avec les procédés de référence documentent la démarche. Le dimensionnement d’une station de traitement classique ou la réalisation d’une étude d’impact réglementaire n’en relèvent pas.
Oncologie, biologie et robotique médicale
Les sociétés qui travaillent sur de nouvelles cibles thérapeutiques ou sur des robots d’assistance chirurgicale cumulent incertitudes biologiques et techniques. Les cahiers de laboratoire, les rapports d’essais sur banc et les comptes rendus des comités scientifiques sont ici essentiels. L’adaptation d’une solution robotique connue à un nouvel usage, sans verrou identifié, relève du développement.
Questions récurrentes dans les dossiers montpelliérains
Des cycles de recherche longs. Quand un programme s’étale sur plusieurs campagnes, chaque déclaration annuelle doit rattacher les dépenses à l’avancement scientifique de l’année. Un rapport annuel, rédigé à chaque fin de saison, évite d’avoir à reconstituer des années d’essais au moment d’un contrôle.
Les partenariats avec les organismes publics. Confier une partie des expériences à une unité du CIRAD, d’INRAE ou de l’université est fréquent. Ces dépenses de sous-traitance sont prises en compte avec des plafonds spécifiques selon les cas, et uniquement pour des organismes publics ou agréés. Une thèse CIFRE est une autre manière de structurer une collaboration de long terme.
La taille de l’entreprise. Beaucoup de structures locales sont des PME. Le statut de PME au sens communautaire conditionne l’accès au crédit d’impôt innovation, utile pour la phase de prototype ou d’installation pilote d’un produit nouveau : 20 % des dépenses en métropole depuis 2025, dans une limite de 400 000 € par an. Il ouvre aussi, pour certaines entreprises, le remboursement immédiat de la créance de CIR.
Le calcul. Le CIR représente 30 % des dépenses de recherche éligibles jusqu’à 100 M€, puis 5 % au-delà. Les dépenses de personnel sont majorées d’un forfait de fonctionnement de 40 % pour les dépenses exposées depuis le 15 février 2025, auquel s’ajoutent les amortissements des équipements de recherche, comme des serres instrumentées ou des plateformes de phénotypage.