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Deux chercheurs assemblent des modules moléculaires autour d’un diagnostic.

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Chimie, biologie moléculaire, médicament et chirurgie assistée par l'image : échangez avec un expert CIR qui connaît les projets de R&D nés autour des laboratoires strasbourgeois.

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Écosystème local

L'innovation à Strasbourg, et ses enjeux CIR

Le tissu de R&D de Grand Est a ses spécificités : secteurs dominants, laboratoires, jeunes pousses. Autant de profils de dépenses éligibles et de justificatifs différents.

Chimie & supramoléculaire

L'Institut de science et d'ingénierie supramoléculaires (ISIS) et les laboratoires de chimie de l'Université de Strasbourg nourrissent des projets en matériaux et molécules fonctionnelles.

Biologie & médicament

L'IGBMC mène des recherches en génétique et biologie cellulaire ; BioValley France, pôle de compétitivité santé du Grand Est, relie entreprises et laboratoires.

Chirurgie & imagerie

L'IHU Strasbourg, l'IRCAD et les Hôpitaux universitaires de Strasbourg travaillent sur la chirurgie mini-invasive guidée par l'image, avec l'appui du laboratoire ICube.

Mis à jour le 2026-10-26

Strasbourg, une recherche tournée vers la molécule et le patient

À Strasbourg, une bonne partie de la R&D d’entreprise prend racine dans les laboratoires de l’Université de Strasbourg. La chimie y occupe une place historique : l’ISIS, institut de science et d’ingénierie supramoléculaires, travaille sur l’assemblage de molécules et les matériaux qui en découlent. Sur le campus d’Illkirch, l’IGBMC conduit des recherches en génétique, biologie moléculaire et cellulaire et en biomédecine, terrain fertile pour les sociétés qui cherchent de nouvelles cibles ou de nouveaux outils d’analyse.

L’autre spécificité locale est la chirurgie guidée par l’image. Sur le site des Hôpitaux universitaires de Strasbourg, l’IHU Strasbourg et l’IRCAD associent cliniciens, ingénieurs et industriels autour de la chirurgie mini-invasive, de la robotique et de l’imagerie médicale. Le laboratoire ICube, consacré aux sciences de l’ingénieur, à l’informatique et à l’imagerie, apporte une partie des briques algorithmiques et robotiques. Le pôle de compétitivité BioValley France, qui couvre la santé à l’échelle du Grand Est et s’inscrit dans une coopération transfrontalière, met en relation entreprises, hôpitaux et laboratoires.

Quels travaux peuvent entrer dans le CIR à Strasbourg

Chimie fine et matériaux moléculaires

Un façonnier ou une jeune société de chimie qui cherche à obtenir un matériau aux propriétés inédites (auto-assemblage contrôlé, catalyseur plus sélectif, polymère réparable) se confronte à un résultat imprévisible. Reproduire une synthèse publiée, augmenter l’échelle d’un procédé par des ajustements classiques ou contrôler la qualité d’un lot ne sont pas de la recherche. Les cahiers de laboratoire, les spectres et chromatogrammes rattachés à chaque essai, et une revue de la littérature qui situe l’objectif par rapport aux travaux publiés sont ici indispensables.

Biotechnologies et découverte de médicaments

Une biotech qui crible des composés sur une cible encore peu étudiée, ou qui met au point un modèle cellulaire plus prédictif, conduit des travaux à l’issue incertaine. La production de réactifs pour la vente, les dossiers administratifs ou la sous-traitance d’analyses standardisées restent en dehors. Il faut pouvoir présenter les plans d’expériences, les résultats bruts, les comptes rendus de réunions scientifiques et le temps consacré par chaque chercheur et technicien. Notre page santé et biotech développe ce point.

Dispositifs médicaux et chirurgie assistée

C’est un domaine où la limite entre recherche et développement est fine. Concevoir un algorithme de segmentation capable de fonctionner sur des images peropératoires de mauvaise qualité, ou un instrument robotisé dont le comportement n’est pas modélisable avec les outils existants, peut être éligible. L’intégration d’un logiciel au bloc, la documentation de marquage CE ou l’ergonomie d’une console ne le sont pas. Les essais précliniques, les comparaisons de performance avec les méthodes publiées et les versions successives des prototypes constituent l’essentiel des preuves.

Une difficulté propre à ce secteur tient au rôle des chirurgiens. Lorsqu’un praticien hospitalier participe aux essais, ses contributions doivent être décrites dans une convention ; elles ne se confondent pas avec le personnel de recherche salarié de l’entreprise. Il est utile de dater chaque version de l’algorithme ou de l’instrument et de rattacher les résultats d’évaluation à la version testée, afin de montrer l’enchaînement des hypothèses au fil des mois.

Les points à surveiller pour les projets alsaciens

Pour le crédit d’impôt recherche, la règle est la suivante : 30 % sur la part des dépenses éligibles qui ne dépasse pas 100 M€, 5 % sur le surplus. Les frais de fonctionnement sont calculés forfaitairement à hauteur de 40 % des dépenses de personnel de R&D, depuis les dépenses exposées à partir du 15 février 2025.

Dans les medtechs, il arrive qu’un projet commence en recherche et se poursuive par la conception d’un prototype ou d’une installation pilote. Cette seconde phase peut relever du crédit d’impôt innovation si l’entreprise est une PME. Son taux est de 20 % en métropole depuis le 1er janvier 2025, avec un plafond de 400 000 € de dépenses par an ; il s’inscrit dans le cadre du RGEC et a été prorogé jusqu’au 31 décembre 2027.

Les liens avec les instituts strasbourgeois sont l’une des forces locales, mais ils exigent de la rigueur. Les travaux confiés à un organisme public ou agréé peuvent être pris en compte, sous des plafonds spécifiques selon les cas ; dans un laboratoire commun, il faut éviter de déclarer deux fois la même dépense. L’accueil d’un doctorant en thèse CIFRE est également fréquent. Rappelons que l’avantage majoré attaché au recrutement d’un jeune docteur n’existe plus depuis la loi de finances 2025. Enfin, la créance peut être remboursée immédiatement pour certaines entreprises, sinon elle s’impute sur l’impôt sur les sociétés.

Un partenaire habitué aux projets de chimie, de biologie ou de dispositifs médicaux en Alsace peut vous aider à préparer un dossier défendable en cas de contrôle.

Comprendre le CIR de A à Z

Ce que la plateforme fait (et ne fait pas). creditimpotsrecherche.com n’est pas un cabinet et n’a pas d’implantation à Strasbourg. Nous ne réalisons pas votre dossier et ne délivrons aucun conseil fiscal personnalisé : nous qualifions votre besoin, puis vous mettons en contact avec un professionnel partenaire compétent sur la zone, que vous restez libre de choisir, de comparer ou de décliner. L’estimation du simulateur est strictement indicative.

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Questions fréquentes

CIR à Strasbourg : vos questions

Développer un logiciel de navigation chirurgicale à Strasbourg, est-ce de la R&D éligible ?
La partie qui cherche à résoudre un problème ouvert, par exemple recaler en temps réel des images préopératoires sur un organe qui se déforme, peut l'être. L'interface utilisateur, la connexion aux équipements du bloc et la mise en conformité réglementaire relèvent du développement et de la certification.
Une biotech alsacienne peut-elle déclarer les travaux réalisés avec un institut public ?
Si les travaux sont confiés à un organisme public ou agréé et qu'ils constituent eux-mêmes de la recherche, les sommes versées peuvent être retenues, dans des plafonds propres à chaque situation. En cas de laboratoire commun, il faut aussi répartir clairement ce que chaque partie finance.
La synthèse d'une nouvelle molécule est-elle toujours éligible ?
Pas automatiquement. Synthétiser un composé par une voie connue, même pour la première fois dans l'entreprise, reste une opération de chimie courante. C'est la recherche d'une voie nouvelle, d'une propriété inattendue ou d'un mécanisme inexpliqué qui fait basculer le projet dans la R&D.
Quand faut-il penser au rescrit pour un projet medtech ?
Le rescrit permet d'interroger l'administration sur l'éligibilité d'un projet avant de déclarer. Il est surtout utile lorsque le projet est important et que la frontière entre recherche et développement est discutable, ce qui arrive souvent avec les dispositifs médicaux.
Le professionnel proposé intervient-il en Alsace ?
Nous recherchons un partenaire qui suit déjà des entreprises alsaciennes ou du Grand Est. Les échanges peuvent se faire sur place ou à distance, et vous restez libre de ne pas donner suite.
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