Des campus aux quatre coins de la ville
La recherche marseillaise ne se concentre pas dans un seul quartier. Aix-Marseille Université répartit ses laboratoires entre Luminy, au bord des calanques, la Timone, à côté des hôpitaux, Saint-Charles près de la gare, Saint-Jérôme et Château-Gombert dans le nord de la ville. Beaucoup de ces unités sont mixtes avec le CNRS ou l’Inserm, ce qui fait de Marseille un territoire où une entreprise a presque toujours un laboratoire public compétent à quelques kilomètres.
Pour une société qui envisage de déclarer ses travaux au titre du crédit d’impôt recherche, cette proximité a deux effets. Elle facilite les collaborations, les thèses et les prestations d’essais. Elle oblige aussi à bien qualifier ce que l’entreprise fait elle-même et ce qu’elle confie à d’autres, car les règles de calcul ne sont pas les mêmes.
Immunologie, mer, énergie : les trois piliers locaux
L’immunologie et les maladies infectieuses. Fondé en 1976, le CIML est placé sous la tutelle conjointe d’Aix-Marseille Université, du CNRS et de l’Inserm. Il travaille aux côtés d’autres équipes de Luminy et de la Timone, de l’IHU Méditerranée Infection et de l’AP-HM. Le cluster Marseille Immunopôle a été créé pour fédérer, sur le territoire, l’immunologie fondamentale et appliquée : recherche, cliniciens et industriels. Les jeunes entreprises de santé peuvent aussi s’appuyer sur Eurobiomed, dont le siège est à Marseille.
La mer. L’Institut Méditerranéen d’Océanologie, implanté sur le campus de Luminy, couvre la biologie marine, la biogéochimie, la physique de l’océan et l’étude des contaminants. Le Pôle Mer Méditerranée, pôle de compétitivité installé à La Seyne-sur-Mer et actif sur toute la façade, de la Corse à l’Occitanie en passant par Marseille, structure ses projets autour de six domaines : défense et sûreté maritime, naval et nautisme, ressources énergétiques et minérales marines, ressources biologiques, littoral et environnement, ports et logistique.
L’énergie, la mécanique et l’espace. Le technopôle de Château-Gombert, regroupe des laboratoires de mécanique-énergétique et le Laboratoire d’Astrophysique de Marseille, qui possède un savoir-faire en instrumentation spatiale. Des plateformes technologiques y sont ouvertes aux entreprises. À l’échelle régionale, Capenergies, basé à Aix-en-Provence, anime les acteurs de la transition énergétique.
Ce qui fait (ou non) un projet de recherche marseillais
Biotechnologies et diagnostic
Une start-up qui cherche à moduler une réponse immunitaire, ou à identifier un biomarqueur prédictif de réponse à un traitement, mène typiquement des travaux à résultat incertain : la cible peut se révéler inexploitable, l’anticorps peu spécifique, le test insuffisamment sensible. Ce sont ces phases de conception, d’expérimentation et d’interprétation qui alimentent le dossier. Les activités réglementaires, la production de lots cliniques à visée commerciale ou la validation analytique d’un kit déjà mis au point relèvent d’une autre logique. Les cahiers de laboratoire signés et datés, les comptes rendus d’expérience et les rapports d’études précliniques en sont les preuves naturelles.
Technologies marines et littorales
Un bureau d’études qui développe un capteur immergé capable de fonctionner longtemps sans maintenance, un modèle de dispersion de polluants en zone portuaire ou un revêtement antifouling sans biocide rencontre des incertitudes physiques et chimiques réelles. Les campagnes en mer ne sont retenues que si elles s’inscrivent dans un protocole expérimental : objectifs, mesures, analyse des écarts. L’ingénierie navale courante, la maintenance d’équipements ou l’installation d’un système connu sur un nouveau quai n’en relèvent pas.
Mécanique des fluides, énergie et instrumentation
Une PME qui optimise un échangeur thermique par simulation numérique doit montrer que les modèles disponibles ne suffisaient pas, par exemple en raison d’un régime d’écoulement atypique. Le développement d’un instrument optique pour l’observation spatiale suit la même règle. Dans les deux cas, les rapports de simulation, la comparaison avec les mesures et l’analyse des écarts constituent la matière du dossier technique. Les calculs de dimensionnement standard et la réalisation d’une machine selon des plans éprouvés n’y ont pas leur place.
Points de vigilance pour un dossier à Marseille
Recherche ou innovation ? Dans les projets de santé, la frontière apparaît souvent au moment où le concept est validé et où l’on conçoit un premier prototype de dispositif ou de kit. Le CIR, à 30 % jusqu’à 100 M€ de dépenses éligibles et 5 % au-delà, couvre la recherche. Le crédit d’impôt innovation, réservé aux PME, peut prendre le relais pour la conception de prototypes de produits nouveaux, au taux de 20 % depuis le 1er janvier 2025 et dans la limite de 400 000 € de dépenses annuelles.
Les prestations des laboratoires. Faire appel à une plateforme de Luminy ou de Château-Gombert est fréquent. Ces dépenses ne sont prises en compte que si le prestataire est un organisme public ou un organisme agréé, avec des plafonds spécifiques selon les cas. Vérifiez l’agrément d’un prestataire privé avant de signer et conservez les rapports remis.
Les projets collaboratifs labellisés. Un projet de pôle mobilise souvent plusieurs partenaires et des aides publiques. Rapprocher son budget, sa répartition des tâches et les aides reçues du dossier CIR correspondant évite les incohérences, et le traitement fiscal de ces aides mérite d’être vérifié avec un professionnel.
Le personnel. Le forfait de fonctionnement est de 40 % des dépenses de personnel de recherche pour les dépenses exposées depuis le 15 février 2025. L’avantage spécifique lié à l’embauche d’un jeune docteur ayant été supprimé à la même date, les docteurs sont désormais déclarés comme le reste du personnel de R&D. Pour le détail des postes retenus, le guide dépenses éligibles fait le point.